现代化、集约化养猪场的猪粪、猪尿、猪粪污水处理有多种不同的处理方法。现代化养猪场利用微生物发酵菌种处理猪粪技术，微元堆肥发酵菌种发酵猪粪制作生物有机肥料。猪粪堆肥发酵技术：以猪粪为主要原料，采用好氧堆肥方式，利用微生物发酵菌种，发酵分解率高、堆肥周期短的高效滚筒卧式发酵装置，对猪粪进行发酵、颗粒化制肥。发酵周期为5-7天。经过在发酵槽中高温好氧发酵，猪粪成为性状良好的腐殖颗粒。然后根据不同农肥的N、P、K等含量标准添加原料，通过粉碎、搅拌后进入造粒装置，成型后经干燥、筛分成为成品，包装后入库或出售。

粪污处理对养猪业的影响愈加明显.当前猪粪处理工艺与设施不少，但一般方式处理量大、机械程度高、一次性投资大，许多中小型猪场无法接受.因此，寻找一种简便、快速、高效、投资低的猪粪处理方法，以解决中小养猪企业的粪污处理问题已成为当务之急.

农户养殖猪处理粪污，除采取沼气池发酵技术外，主要采取粪污堆肥发酵形成农家肥，然后将粪肥还田，从而基本达到“粪肥还田、零排放、无污染”的环保目标。通常情况下，饲养户除了要在猪舍旁边挖贮粪池，暂时贮存粪污，还要在种植地块附近挖条状贮粪坑进行堆肥发酵。堆肥是一种优质农家肥料，所含营养物质比较丰富，且肥效长而稳定，常年使用，有利于促进土壤团粒结构的形成，能增加土壤保水、保温、透气、保肥的能力。堆肥是利用各种植物残体（作物秸秆等）为主要原料，混合猪粪尿经堆制腐熟分解而形成的农家肥料。由于它的堆制材料、堆制原理和其肥分的组成及性质和厩肥相类似，所以又称人工厩肥。

主要利用微元堆肥堆肥发酵菌的作用，将植物有机残体，进行矿质化、腐殖化和无害化，使各种复杂的有机态的养分，转化为可溶性养分和腐殖质，同时利用堆积时所产生的高温（60℃—70℃）来杀死原材料中所带来的病菌、虫卵和杂草种子，达到无害化的目的。因此，为了获得优质堆肥，在堆制过程中，千方百计地为微生物的生命活动创造良好的条件，是加快堆肥腐熟和提高肥效的关键。