土壤改良微生物冲施肥是一种微生物产品，含有多种高浓度高活性的有益微生物菌群。微生物冲施肥中的生物菌群能通过土壤吸收养分，尤其是对钾和存在于磷酸盐（PO43-）中磷的吸收效果突出．并将这些养分转移给植物来弥补根部生长不良的缺陷。土壤改良微生物菌肥中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0。1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物菌肥能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。

    微生物有机肥料能改良土壤、培肥地力，增加产量和改善品质等。与化肥配合施用后，这些作用更能进一步提高，微生物有机肥料中的主要物质是有机质，施用微生物有机肥料增加了土壤中的有机质含量。有机质可以改良土壤物理、化学和生物特性，熟化土壤，培肥地力。我国农村的“地靠粪养，苗靠粪长”的谚语，在一定程度上也反映了施用微生物有机肥料有改良土壤的作用。

    这些有益生物菌与植物形成一种共生关系，刺激植物根部的分枝并增大根部吸收面积，起到固氮、解磷、解钾、促进植物根系生长并保护植物不受致病菌侵害的作用。这些有益生物菌群生长在主体植物的根部，并与主体植物形成共生关系，不仅可以捉进植物根系的生长，为其提供所需的营养成分，同时植物也为有益菌的生长提供了条件。单施低量有机肥，或低量有机肥与氮素化肥配合的处理，土壤中的磷都是亏缺的。只有施用高量有机肥，和高量有机肥与化肥的配合处理，土壤中的磷才有盈余，速效钾增加。施用有机肥对土壤磷、钾素平衡十分重要。说明要改良土壤，应高量施用有机肥。

    施用微生物有机肥料不仅增加许多有机胶体，同时借助微生物的作用把许多有机物也分解转化成有机胶体，因此可大大增加了土壤吸附表面，并且产生许多胶粘物质，使土壤颗粒胶结起来变成稳定的团粒结构，提高了土壤保水、保肥和透气的性能，以及调节土壤温度的能力，起到改良土壤的作用。根部长有这些有益生物菌群的植物可以更好的吸收磷，并增强其抗盐、杭旱、保持水分平衡的能力从而促进植物本身的生长发育。蔬莱、果树、大姜、草莓等与有益生物菌群有共生关系的植物在以下方面性能更好：耐土壤高温、调节PH值、抗致病菌侵害以及抗重金属毒性。

    微生物冲施肥含有多种高浓度的非致病性有益微生物菌群包括凝结芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、棕色固氮菌、胶质芽孢杆菌、米曲霉、长柄木霉。这些有益生物菌群能与植物形成共生关系，促进植物根系生长，保护植物充分吸收养分的同时，植物也为其提供了养分。施用微生物有机肥料，还可使土壤中的微生物大量繁殖，特别是许多有益的微生物，如固氮菌、氨化菌、纤维素分解菌、硝化菌等。微生物有机肥料中有动物消化道分泌的各种活性酶，以及微生物产生的各种酶，这些物质施到土壤后，可大大提高土壤的酶活性。多施微生物有机肥料，可以提高土壤活性和生物繁殖转化能力，从而提高土壤的吸收能力、缓冲性和抗逆性能，也起到土壤改良作用。