农家肥料不但含有各种大量和中微量元素，而且含有一些能刺激根系生长的物质以及各种有益土壤微生物；农家肥基本都是在农村中就地取材，就地积制，故来源广，成本低；农家肥中大部分养分都以复杂的有机态存在，需经微生物转化分解才能释放出各种有效态养分供作物吸收，这个过程较慢，因此肥效慢，但肥效长；农家肥中含有丰富的腐植酸。

堆肥过程是一个对植物遗体及其他一年生植物的分解过程，该过程中能产生一些对室内植物或富饶菜园土地非常有帮助的物质。在自然界，有机废物会在生化过程中被分解。蠕虫、昆虫、真菌、细菌和其他微生物都能将废物“嚼碎”。好的发酵过程会给微生物提供适宜的环境条件。发酵菌种是由几十亿个消耗农业、工业和城市废物的微生物（包括真菌、细菌等）制成的。这些微生物会慢慢地将各种废物分解掉。分解的产物又通过氧化（空气中）、还原和水解（水中）反应被进一步转化。

在热带和亚热带地区，全年中大部分时间都很温暖，因而堆肥过程很少利用嗜冷微生物。大多数堆肥过程都是由嗜温微生物从中温开始的，嗜热微生物也能将堆肥的温度升至热温范围。堆肥中的微生物在分解过程中产生大量的热来给堆肥加热。55-70度在适当保存的堆肥中属于正常温度。这种高温对快速分解是必需的，而且有利于破坏杂草的草种、昆虫的幼虫、有害细菌等，并能抑制某些疾病的滋生，以免这些疾病产生有害微生物阻碍植物的正常生长。

农家肥堆肥腐熟发酵，农家肥的堆积方法分为普通堆肥和高温堆肥两种，普遍堆肥酵温度较低，且腐熟过程中成分变化不大，所需堆制时间较长。高温堆肥是以含纤维多的原料为主，加入适量的马粪和人尿，加入微生物堆肥发酵菌种一起发酵，发酵的温度较高。堆肥过程是一个对植物遗体及其他一年生植物的分解过程，该过程中能产生一些对室内植物或富饶菜园土地非常有帮助的物质。

微生物堆肥发酵菌种的添加能够提高分解速度与效率，因为这些菌群是经过筛选、驯化、培养并改良的高浓缩细菌与真菌混合物。这些菌种被选来更好的生存与繁殖、同时制造酶并分解有机废物，从而在堆肥生成过程中加速有机质的分解。堆肥中的微生物在分解过程中产生大量的热来给堆肥加热。90-140华氏度在适当保存的堆肥中属于正常温度。这种高温对快速分解是必需的，而且有利于破坏杂草的草种、昆虫的幼虫、有害细菌等，并能抑制某些疾病的滋生，以免这些疾病产生有害微生物阻碍植物的正常生长。

分解木质纤维素菌体的标准概念是先打开纤维结构使糖可用于不同微生物的新陈代谢。微生物利用纤维素酶、木聚糖酶、a-淀粉酶、蛋白酶、分解木质素的酶等从纤维素、半纤维素、蛋白质、淀粉和其他碳水化合物中向堆肥释放糖分。目标菌在堆肥中的生长加强了，就能有效抑制杂菌和脊椎动物的生长，从而防止产生臭味和致病菌等有害物质。发酵原住微生物堆肥发酵菌种的添加能够提高分解速度与效率，因为这些菌群是经过筛选、调试、培养并改良的高浓缩细菌与真菌混合物。这些菌种被选来更好的生存与繁殖、同时制造酶并分解有机废物，从而在堆肥生成过程中加速有机质的分解。分解木质纤维素菌体的标准概念是先打开纤维结构使糖可用于不同微生物的新陈代谢。

微生物利用纤维素酶、木聚糖酶、a-淀粉酶、分解木质素的酶等在堆肥中从纤维素、半纤维素、淀粉和其他碳水化合物里释放糖分。目标菌在堆肥中的生长加强了，就能有效抑制杂菌和脊椎动物的生长，从而防止产生臭味和致病菌等有害物质。农家肥料不但含有各种大量和中微量元素，而且含有一些能刺激根系生长的物质以及各种有益土壤微生物；农家肥基本都是在农村中就地取材，就地积制，故来源广，成本低；农家肥中大部分养分都以复杂的有机态存在，需经微生物转化分解才能释放出各种有效态养分供作物吸收，这个过程较慢，因此肥效慢，但肥效长；农家肥中含有丰富的腐植酸，能促进土壤团粒结构的形成，使土壤变得松软，改善土壤水分和空气条件，利于根系生长;增加土壤保肥保水性能;提高地温，促进土壤中有益微生物的活动和繁殖等。

农家肥宜作底肥使用，不宜作追肥。根据作物选择化肥：不同作物需要的营养元素及数量不同，对各种营养元素的吸收能力也不同。如玉米需氮多，而大豆自身固定氮，对氮肥的需要量较少，但需钾多于玉米，而大豆吸磷能力强，玉米吸磷能力低于大豆，所以含水溶性磷高的磷酸二铵应优先分配给玉米，而将含水溶性磷低的过磷酸钙等多分配给大豆等吸磷能力强作物。最好的选择化肥的方法应该是针对不同的作物，选择相应的作物专用肥。作物专用肥能合理地供应作物所需养分，提高肥效，减少农业投入成本，达到高效、高产和优质的目的。

农家肥如马、牛、猪、鸡粪必须腐熟后施用，由于农家肥养分释放慢、肥效长，且养分释放与作物需要的时间常不一致，必须与化肥配合使用，才能充分发挥其效益。一些有机肥有臭味，病原菌、寄生生卵等，有些还含有过量的重金属及有害物质，须无害化处理后，方可施用，畜禽粪便当年堆制第二年施用较为适宜(能充分发酵、腐熟)。