有机肥堆肥发酵技术把有机肥原料经过微生物高温腐熟发酵，有机肥原料可以是鸡粪、羊粪、猪粪、牛粪、马粪、兔粪、鸽粪等禽畜粪便及畜牧粪便，混合其他农业有机固体废弃物如秸秆、蘑菇渣等有机物质。有机肥堆肥发酵技术如果按照普通的堆肥发酵方法处理的话，不仅时间长，而且无法达到100%完全腐熟。最新的有机肥堆肥发酵技术，就是使用堆肥快速腐熟剂堆肥发酵有机肥原料，也可以借助堆肥腐熟发酵设备，腐熟发酵更快，时间更短。

有机肥原料可以是鸡粪、羊粪、猪粪、牛粪、马粪、兔粪、鸽粪等禽畜粪便及畜牧粪便等都是农村或者农场或者养殖场最常见的有机废弃物，跟是最好的有机肥原材料。有机肥堆肥发酵技术利用微生物发酵菌制作堆肥使用是一种将有机肥原料制作生物肥料利用的一种方式，有机肥原料在堆肥过程是一个对植物遗体及其他一年生植物的分解过程，该过程中能产生一些对室内植物或富饶菜园土地非常有帮助的物质。在自然界，有机废物会在生化过程中被分解。蠕虫、昆虫、真菌、细菌和其他微生物都能将废物“嚼碎”。好的发酵过程会给微生物提供适宜的环境条件。在堆肥中加入微生物发酵菌，可以加速畜禽粪便及秸秆类物质的快速分解和腐熟，大大提高生产效益。

鸡粪、羊粪、猪粪、牛粪、马粪、兔粪、鸽粪等禽畜粪便及畜牧粪便有机性废弃物是堆肥中微生物赖以生存、繁殖的物质条件，由于微生物生活时有的需要氧气，有的不需要氧气，因此，根据处理过程中起作用的微生物对氧气要求不同，有机性废弃物堆肥化处理可分为好氧堆肥法（高温堆肥法）和厌氧堆肥法二种。前者都是在通气条件下借助好氧微生物活动使有机物得到降解，由于好氧堆肥温度一般在50～60度，最高可达70～80度，故也称为高温堆肥。后者是利用厌氧微生物发酵进行肥料制作的过程。

禽畜粪便及畜牧粪便与其他有机固体废弃物好氧堆肥是在有氧的条件下，借助好氧微生物的作用来进行的。在堆肥过程中，有机性废弃物中的溶解性有机物质透过微生物的细胞壁和细胞膜为微生物吸收，固体和胶体的有机物先附着在微生物体外，由微生物所分泌的胞外酶分解为溶解性物质后再渗入细胞。微生物通过自身的生命活动——氧化、还原和合成过程，把一部分有机物氧化成简单的无机物，释放出生命活动所需的能量，并把一部分有机物转化为生物体所必须的营养物质以合成新的细胞物质，于是微生物逐渐生长繁殖产生更多的生物体。

在堆肥过程中通过搅拌和强制通风向堆肥内部通入氧气，促进好氧性微生物活动。由于堆肥原料、空气和土壤存在着大量的各种微生物，所以后很快就进入发酵阶段。首先微生物利用易分解性有机物进行繁殖，产生二氧化水，同时产生热量使堆肥升温。发酵初期有机物质的分解主要是靠中温型微生物（30～40度）进行的，随着温度的升高，最适宜生活在45～65度的高温菌逐渐取代了中温型微生物。在此温度下，各种病原菌、寄生虫卵、杂草种子等均可被灭杀。

畜禽粪便主要包括猪、牛、羊、马等家畜粪便和鸡、鸭等家禽粪便。根据不同粪便的排放方式、粪便量、养分含量等特点，选择不同的处理方法。其中，家禽的粪便中有机质和氮、磷、钾养分含量都较高，并含有较多的钙等其他中量和微量元素，家禽粪便容易腐熟并且腐熟温度较高，属于热性肥料；猪粪质地较细，含有较多的有机质和氮、磷、钾养分，含有大量的腐殖质，对提高土壤肥力有很好的作用；牛粪属于冷性肥料，其中的有机质部分较难分解，腐熟较慢，发酵温度较低；羊粪质地较细，含水量少，羊尿中氮和钾含量较高，其氮素形态主要是尿素态氮，易被分解利用；马粪尿中有机质含量较高，还含有大量的纤维分解菌，在堆肥时能产生高温，属于热性肥料。