有机肥料和生物肥料在生产制作中都要使用的微生物肥料菌剂，优质的微生物肥料菌剂在发酵的过程中会起到非常好的效果，在购买有机肥发酵剂或者生物肥发酵剂时，要选择优质的微生物肥料菌剂。微生物肥料菌剂产品按剂型可分为液体、粉剂、颗粒型；按内含的微生物种类或功能特性可分为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。

化学肥料-有机物-微生物肥料菌剂相互作用的研究：化肥和有机物混合物中化肥和微生物制剂接触时间对微生物活性的影响，因化肥浓度的不同而异，固氮菌在低浓度时随时间的延长活菌数反而增加；解磷和解钾菌都具有中间活菌减少后期增加的现象。在一定化肥浓度范围内，化肥浓度越高固氮菌活菌数越低，化肥浓度较低时，无机养分可以促进固氮菌的生长；化肥的浓度影响解磷菌的活性，但是，不如化肥接种时间和化肥品种影响显著；化肥浓度显著影响解钾菌的活性，化肥在低浓度时能够促进解钾菌的生长。化肥的组成对固氮菌、解磷菌和解钾菌存活和生长的影响比较复杂，而且影响显著。

微生物肥料是添加了经过工业化扩繁的活体微生物的肥料，通过微生物的生命活动，使作物达到增加养分供给量，达到增产作物的这一大类肥料，微生物肥料最主要的特点就是里边含有活体的微生物，根据活体微生物的类别、数量以及肥料养分的不同，微生物肥料可以分为微生物菌剂、生物有机肥以及复合微生物肥料这三大类。

第一类叫做微生物菌剂，它主要是以有效活菌数作物考量的标准，目前国内普遍应用的菌种有固氮菌、解磷菌、解钾菌，还有枯草芽孢杆菌等。第二类是生物有机肥，考量的标准就是有机质的含量，必须大于等于25%以上，有效活菌数要大于等于两千万，这类的产品是能提供一定的有机肥的作用和生物肥的作用结合到一块，第三类叫做复合微生物肥料，主要考量的标准是氮磷钾的养分要大于等于25以上，它的有效活菌要大于等于两千万以上。因为微生物肥料里边含有活体微生物，是一类有生命的肥料，而且正是通过微生物的活动发挥肥效的作用，因此它与咱们平时使用的化肥还是存在差别的。

微生物肥料生产和施用进入一个新的时期，生产条件、施用条件及其他技术均有很大进步，证明了微生物肥料的确实作用。化学肥料具有养分浓度高、效果快和养分单一的特点，有机肥的特点是养分含量低、养分齐全、效果缓慢和能够吸附化肥离子使其缓慢释放，微生物肥料具有肥效慢、固定或分解土壤中营养元素、需要有机营养和吸附剂的特点。三者的合理搭配将是理想的肥料品种，但是，由于微生物肥料中活的菌体受盐分、温度等的影响，三者合一后往往造成微生物生存不利，因此，研究化肥品种、浓度形态在有机环境下，对微生物肥料菌剂活性的影响，对生物有机无机混合肥料的生产非常重要。

微生物肥料是由一种或数种有益微生物、经工业化培养发酵而成的生物性肥料。通常把微生物肥料分为两类：一类是通过其中所含微生物的生命活动，增加了植物营养元素的供应量，导致植物营养状况的改善，进而增加产量，其代表品种是菌肥；另一类是广义的微生物肥料，虽然也是通过其所含的微生物生命活动作用使作物增产，但它不仅仅限于提高植物营养元素的供应水平，还包括了它们所产生的次生代谢物质，如激素类物质对植物的刺激作用，促进植物对营养元素的吸收利用，或者能够抵抗某些病原微生物的致病作用，减轻病虫害，从而提高农作物产量和品质。