生物饲料发酵技术是创新传统饲料发酵的技术，生物饲料发酵剂的种类也比较多类型，其中就以纳豆芽孢杆菌菌种生物饲料发酵剂最受各大生物饲料厂商的选择。生物发酵饲料在人工控制条件下，纳豆芽孢杆菌微生物通过自身的代谢活动，将植物性、动物性和矿物性物质中的抗营养因子分解、合成，产生更能被畜、禽采食、消化、吸收养分和无毒害作用的单一饲料，称为生物发酵饲料。

纳豆芽孢杆菌属于好氧菌，生长和繁殖消耗肠道内氧气，减少有害好氧菌的生存机会，促进了有益厌氧菌（乳酸菌、双歧杆菌等）的活动；纳豆芽孢杆菌能有效调整动物肠道菌群数量的变化，起到维持肠道微生态平衡的作由于纳豆芽孢杆菌等好氧菌的大量补充，为动物道内的乳酸菌和双歧杆菌提供了厌氧环境和营养，使有益菌群在肠道黏膜上形成一层正常的微生物屏障，避免致病菌的入侵。纳豆芽孢杆菌促进了乳酸菌和双歧杆菌等有益厌氧菌的活动，产生各种有机酸，降低肠道pH，减少大肠杆菌、变形杆菌等有害菌的生长。已有报道指出，在乳酸菌的作用下，大肠杆菌、克雷伯菌、变形杆菌等致病菌的细胞壁被破坏，变成无致病性的L型细菌。

因此，纳豆芽孢杆菌等有益菌可以产生抑菌物质和各种有机酸，能够有效的抑制病原菌的生长繁殖，减少致病菌的数量。纳豆芽孢杆菌的抑菌作用不但源于生物间的拮抗作用，还由于其能产生多种抗菌素如2,6-吡啶二羧酸，杆菌肽，多黏菌肽，这些物质对痢疾杆菌、原发性大肠杆菌O157、O111、O144、伤寒菌、沙门氏菌等有害菌，清除毒素作用，维持肠道微生态平衡。纳豆芽孢杆菌对沙门氏寒菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌三种致病菌有较强的抑制性。

纳豆芽孢杆菌菌种发酵生物饲料养殖动物的功效：一、促进饲料营养成分的转化，提高饲料转化率，降低料肉比，节省饲料；二、促进生长，增重，缩短饲养时间，可提前出栏；三、抑制有害菌的繁殖，增加有益菌群的优势，提高发酵床养猪效率；四、明显提高免疫能力和抗应激能力，减少仔猪黄白痢，顽固性腹泻，肠胃炎，群发性肠炎和肠道感染，减低死亡率；五、减少饲料浪费，降低可利用养份（蛋白质）排出体外，并消除排泄物的恶臭，进而改善整体环境，减少呼吸道及其他疾病的发生。

生物饲料发酵剂微生物纳豆芽孢杆菌高活性的消化酶促进了营养物质的消化，酵素中含有高活性的淀粉酶和蛋白酶，同时纳豆芽孢杆菌分泌大量蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶等，两方面共同促进了营养物质的分解，转化成易被猪吸收利用的小分子物质；纳豆芽孢杆菌分泌高活性的纳豆激酶，具有很高的纤维蛋白的分解活性，其分解产生的短肽更容易被胃肠道吸收；在高活性淀粉酶的作用下，淀粉在消化道内的分解更为迅速；同时，芽孢杆菌分泌纤维素酶，使猪可以利用部分纤维素。

利用纳豆芽孢杆菌对饲料进行发酵，提前能把饲料的中的营养及早分离，纳豆芽孢杆菌在发酵过程中就把饲料的葡萄糖、蛋白质等营养物质提前分解，在猪进食之后很容易的吸收，提高饲料的吸收率，同时发酵饲料中有大量的益生菌存在，抑制饲料中的有害菌，动物在进食之后加快吸收，减少动物的消化道的疾病发生。同时在发酵饲料中可以大量加植物纤维，能把植物纤维转化成容易吸收的植物蛋白，也能分解出来一部分营养。降低饲料成本，提高经济效益，同时也达到防病治病的效果。